十三科是中國古代醫學分科的合稱。

　　元代及明代的大部分時期，太醫院都將醫學分為十三科。元代的十三科為：大方脈、雜醫、小方脈、風、產、眼、口齒、咽喉、正骨、金瘡腫、針灸、祝由、禁。并規定：諸醫人于十三科內，不能精通一科者不得行醫。”

　　明代醫學十三科為：大方脈、小方脈、婦人、瘡瘍、針灸、眼科、口齒、咽喉、接骨、傷寒、金鏃、按摩、祝由。隆慶五年（公元1571年）十三科又改作十一科。

　　最早將醫學分為十三科可追溯至北宋熙寧九年（公元1076年）。此時的十三科為：大方脈、風科、小方脈、針、灸、口齒、咽喉、眼、耳、瘡腫、傷折、金瘡、書禁。元豐改制后又在嘉祐九科之基礎上進行調整仍為九科。因此北宋時醫學劃分為十三科為時甚暫。

　　各科詳解：

　　大方脈，指專治成人內科疾病的一科，相當於現在的內科。

　　小方脈科，是幼科的別稱，專治小兒疾病，相當于現在的小兒科。唐代已有少小科，宋代開始，兒科稱為小方脈。宋以后，元、明、清太醫院中均設有小方脈科。

　　婦人科，是指治療婦女病的專科，又稱“女科”，相當於現在的婦產科。

　　風科，范圍包括各種因“風”邪所致的疾病。宋代設風科僅次於大方脈，有學生八十人。

　　正骨科，是診治損傷的專科，亦有稱為傷科或骨傷科的，是指用推、拽、按、捺等手法治療外力作用所致的骨、關節和軟組織的損傷，但也包括同類原因引致的體內臟器損傷。

　　金鏃科，是指專門治療刀、槍、箭傷等戰傷的一門科學。

　　金瘡科，也是指治療刀斧利刃之物所傷的醫科。

　　產科，主治胎前、產后及婦科諸癥。

　　眼科，主治眼病及時疫眼病。

　　口齒科，主治牙痛、骨鯁及喉科諸癥。

　　傷折科，主治跌打壓傷及諸蟲獸傷。

　　瘡腫科，主治惡瘡、癩疥、無名腫毒等。

　　祝由科，古代用祝說病由的迷信方法以治療疾病者叫做祝由。“祝”者，咒也；“由”者，病的原由也。祝說，就是裝出一副能通鬼神之事的模樣，祝禱鬼神消災免難，解除病人的疾病痛苦。或稱咒禁科。也包括使用中草藥在內的借符咒禁禳來治療疾病等方法。

　　書禁科，主治鎮邪、驅鬼、辟毒、截癥等。