瞿曇寺位于青海省海東市樂都縣城南21公里處的馬圈溝口，是中國西北地區保存最完整的明朝藏傳佛教格魯派寺院。藏語稱“卓倉拉康果丹代”，又稱“卓倉多杰羌”，意為“卓倉持金剛佛寺”，該寺因所藏珍貴文物以及巨幅彩色壁畫而聞名，是第二批全國重點文物保護單位之一。

青海瞿曇寺·白塔

　　瞿曇寺寺院選建在雄渾而清幽的風水形勝之地，沿著南向偏東的軸線布局，背倚羅漢山，前臨瞿曇河，面朝鳳凰山，遠可望雪山，同自然環境有機和諧地融成一體。瞿曇寺之所以被人譽為“小故宮”，是因為它有著明朝漢式的建筑風格，其中不少還是仿照明故宮的建筑形式。全寺共有前、中、后三進院落，寺院5座主要殿宇在中軸線上一一縱列，兩側游廊配殿對稱環立，整座寺院端正、大氣、素雅。

青海瞿曇寺·山門

　　建于明初的瞿曇寺是一座藏傳佛教寺院，但卻有著漢式建筑風格，實屬罕見。其占地15000平方米，建筑面積約10000平方米，整個寺院修建在一個方形土堡中，全寺由前、中、后三進院落組成，并在一條中軸線上。從山門起的的中軸線上，依次為山門、金剛殿、瞿曇殿、寶光殿、隆國殿等大型宮殿式建筑，兩側則對稱地建有御碑亭、小鐘鼓樓、回廊、寶塔、配殿、經堂、大鐘鼓樓等。從高處俯瞰，瞿曇寺縱橫分明，宛如明時小故宮。

　　瞿曇殿位于中院前部，始建于明朝洪武二十五年（1392年），清朝乾隆四十七年（1782年）重修并改建。

瞿曇寺建筑·寶光殿

　　隆國殿居于寺院最后，是全寺最大、最為輝煌的建筑，重檐廡殿頂，高16米，寬7間，深5架。大殿雄峙于3.2米的花崗巖臺基上，前設束腰式月臺，四面設明廊，兩山和后檐砌磚墻，前檐的明間和兩次裝四抹隔扇，具有很高的建筑藝術水平。

青海瞿曇寺·長廊壁畫

　　壁畫廊（七十二間走水廳）內有巨幅彩色壁畫，是西北最古老、最完整描述佛祖釋迦牟尼一生的壁畫。面積大約400平方米，主要為佛本生故事，如《叨利天眾迎佛升天宮圖》、《善明菩薩在無憂樹下降生》、《凈飯王新城七寶衣履太子體》、《龍王迎佛入龍宮圖》、《六宮娛女霧太子歸宮圖》等。壁畫形象生動，色彩鮮艷。

瞿曇寺·匾額

　　瞿曇寺現存明朝漢藏文對照御制碑以及明清匾額十塊，明朝宣德二年所鑄青銅大鐘一口，香爐三鼎，明鈸、象牙佛珠、檀香木佛珠，米拉日巴石雕像，明清皇帝所賜的金印、景泰藍花瓶、象牙塔等許多珍貴文物。

　　瞿曇寺曾紅極一時、盛極一方，曾領屬周邊13寺，有數千戶農牧民世代為寺院納糧服役。然而隨著明朝的衰亡它便逐漸勢微，尤其是因為受到羅卜藏丹津叛亂的牽連，清王朝停止了對瞿曇寺的賞賜，不僅取消佛差，而且連入寺的僧人也有所限制，使得曾經多達500人的僧眾被減至300人，到1949年前為60人。直到近年瞿曇寺修復后，寺院才又有了僧侶活動。